Theo Thông tư, đối tượng áp dụng thu phí sử dụng đường bộ trạm thu phí cầu Việt Trì mới, tỉnh Phú Thọ thực hiện theo quy định tại Điều 3, Điều 4 và Điều 5 Thông tư số 159/2013/TT-BTC ngày 14/11/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí sử dụng đường bộ để hoàn vốn đầu tư xây dựng đường bộ (sau đây gọi tắt là Thông tư số 159/2013/TT-BTC).
Đối tượng chịu phí thấp nhất là xe dưới 12 ghế ngồi, xe tải có tải trọng dưới 2 tấn và các loại xe buýt vận tải khách công cộng chịu phí mỗi lượt là 35.000 đồng, còn xe tải có tải trọng từ 18 tấn trở lên và xe chở hàng bằng container 40 fit chịu phí cao nhất là 180.000 đồng/lượt.
Chứng từ thu phí sử dụng đường bộ sử dụng tại trạm thu phí cầu Việt Trì mới, tỉnh Phú Thọ thực hiện theo quy định tại Điều 9 Thông tư số 159/2013/TT-BTC.
Thông tư quy định phí sử dụng đường bộ trạm thu phí cầu Việt Trì mới, tỉnh Phú Thọ được thu, nộp, quản lý và sử dụng theo quy định tại Điều 8 Thông tư số 159/2013/TT-BTC.
Tổng số tiền thu phí hàng năm sau khi trừ các khoản thuế theo quy định được xác định là khoản tiền hoàn vốn theo phương án tài chính của Hợp đồng BOT Dự án đầu tư xây dựng cầu Việt Trì mới, tỉnh Phú Thọ.
Đơn vị được Bộ Giao thông vận tải giao nhiệm vụ tổ chức thu phí sử dụng đường bộ trạm thu phí cầu Việt Trì mới, tỉnh Phú Thọ có trách nhiệm tổ chức các điểm bán vé tại trạm thu phí thuận tiện cho người điều khiển phương tiện giao thông, tránh ùn tắc giao thông, bán kịp thời đầy đủ các loại vé theo yêu cầu của người mua, không hạn chế thời gian bán vé tháng, vé quý.
Đồng thời, thực hiện đăng ký, kê khai, thu, nộp, sử dụng chứng từ thu, công khai chế độ thu phí sử dụng đường bộ theo quy định. Báo cáo kết quả thu phí định kỳ tháng, quý, năm theo quy định của Tổng cục Đường bộ Việt Nam và Bộ Giao thông vận tải.
Thông tư này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 10/7/2015. Thời gian bắt đầu thu phí theo mức phí tại Thông tư này kể từ khi có đủ điều kiện sau: Dự án được Bộ Giao thông vận tải cho phép và đã thực hiện nghiệm thu hoàn thành, đưa vào sử dụng; Được Bộ Giao thông vận tải ban hành Quyết định cho phép thu phí.