Kể từ ngày 1/11/2013 người khai hải quan thực hiện sử dụng chữ ký số đã đăng ký với cơ quan hải quan khi thực hiện thủ tục HQĐT theo quy định tại Điều 4 Nghị định số 87/2012/NĐ-CP ngày 23/10/2012 của Chính phủ và Điều 5 Thông tư số 196/2012/TT-BTC ngày 15/11/2012 của Bộ Tài chính.
Bộ Tài chính giao Tổng cục Hải quan chịu trách nhiệm tổ chức hướng dẫn người khai hải quan thực hiện sử dụng chữ ký số công cộng trong thủ tục HQĐT.
Việc thực hiện sử dụng chữ ký điện tử trong hoạt động hải quan cũng đã được Chính phủ, Bộ Tài chính quy định khá rõ và nhận được sự quan tâm của cộng đồng DN.
Điều 4 Nghị định số 87/2012/NĐ-CP quy định “Quyền và nghĩa vụ của người khai hải quan điện tử” quy định:
Khi thực hiện thủ tục hải quan điện tử, người khai hải quan phải sử dụng chữ ký số đã đăng ký với cơ quan Hải quan. Trong giai đoạn chưa có chữ ký số thì được sử dụng tài khoản truy nhập Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan để thực hiện thủ tục HQĐT. Người khai hải quan có trách nhiệm bảo mật tài khoản để sử dụng khi giao dịch với cơ quan Hải quan thông qua Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan và chịu trách nhiệm về các giao dịch điện tử theo quy định của pháp luật.
Điều 5 Thông tư số 196/2012/TT-BTC quy định “Sử dụng chữ ký số trong thực hiện thủ tục hải quan điện tử” có một số điểm đáng lưu ý.
- Chữ ký số sử dụng trong thủ tục hải quan điện tử của người khai hải quan là chữ ký số công cộng đã được cơ quan Hải quan xác nhận tương thích với Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan. Danh sách các tổ chức cung cấp dịch vụ chứng thực chữ ký số công cộng cung cấp chữ ký số tương thích với Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan được đăng tải trên Cổng Thông tin điện tử hải quan (http://www.customs.gov.vn).
-Việc sử dụng chữ ký số và giá trị pháp lý của chữ ký số, thực hiện theo quy định tại Điều 8 và Điều 12 Nghị định số 26/2007/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Luật giao dịch điện tử về chữ ký số và dịch vụ chứng thực chữ ký số.
-Trước khi sử dụng chữ ký số để thực hiện thủ tục hải quan điện tử, người khai hải quan phải đăng ký chữ ký số với cơ quan Hải quan thông qua Cổng thông tin điện tử hải quan.
-Không quá 2 phút kể từ thời điểm kết thúc việc đăng ký, thông qua Cổng Thông tin điện tử hải quan, cơ quan Hải quan trả lời chấp nhận hoặc từ chối (có nêu rõ lý do) chữ ký số của người khai hải quan.