Trong ngành Hải quan, các vụ, cục nghiệp vụ và cục, chi cục hải quan các tỉnh, thành phố đều có các tổ chức pháp chế và cải cách hành chính, tư pháp nằm trong các phòng tổng hợp, văn phòng. Việc thực hiện các quan hệ phối hợp giữa các tổ chức pháp chế và cải cách hành chính, tư pháp trong thời gian vừa qua đã đem lại hiệu quả thiết thực.

Hải quan là một ngành đặc thù với nhiều quy trình nghiệp vụ phức tạp, đối tượng quản lý đa dạng. Để hoạt động hiệu quả, ngành Hải quan cần chú trọng bồi dưỡng và nâng cao ý thức chủ động nghiên cứu và áp dụng các tác động tâm lý, nhất là trong quá trình tuần tra, kiểm soát hải quan.