Một trong những đặc trưng của Vụ Quản lý thuế doanh nghiệp lớn tiền thân của Cục Thuế doanh nghiệp lớn là thường triển khai các đề án thí điểm, mang tính dài hạn, có tác động lan tỏa lớn. Cũng từ thực tiễn công tác quản lý thuế doanh nghiệp lớn, Cục Thuế doanh nghiệp lớn đã chủ động đề xuất với lãnh đạo Tổng cục Thuế, lãnh đạo Bộ Tài chính cho triển khai nghiên cứu xây dựng nhiều đề án quan trọng mà đến nay đã được bổ sung, hoàn thiện để đưa vào áp dụng, có kết quả thiết thực.