Theo hướng dẫn của Bộ Tài chính, tại tiết a Khoản 3 Điều 3 Thông tư 80/2012/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn Luật Quản lý thuế về Đăng ký thuế có quy định về mã số thuế:

“Tổ chức, cá nhân quy định tại Điều 2 Thông tư này được cấp một mã số thuế duy nhất để sử dụng trong suốt quá trình hoạt động từ khi đăng ký thuế cho đến khi chấm dứt hoạt động, trừ các trường hợp quy định tại điểm d, đ, e khoản này. Mã số thuế được dùng để khai thuế, nộp thuế cho tất cả các loại thuế mà người nộp thuế phải nộp, kể cả trường hợp người nộp thuế kinh doanh nhiều ngành nghề khác nhau hoặc hoạt động sản xuất kinh doanh tại các địa bàn khác nhau.

Mã số thuế đã cấp không được sử dụng để cấp cho người nộp thuế khác. Tổ chức kinh doanh khi chấm dứt hoạt động thì mã số thuế chấm dứt hiệu lực và không được sử dụng lại.

Mã số thuế đã cấp cho người nộp thuế là chủ hộ kinh doanh hoặc một cá nhân không thay đổi trong suốt cuộc đời của cá nhân đó, kể cả trường hợp đã ngừng hoạt động kinh doanh sau đó kinh doanh trở lại.”...

Đối với trường hợp doanh nghiệp có một cá nhân làm công ăn lương, đã từng làm việc ở nơi khác. Tuy nhiên khi hỏi MST để kê khai thuế TNCN cho cá nhân không nhớ là đã được cấp MST chưa, số CMT cũ cũng không nhớ do bị mất và đã được Cơ quan công an cấp một số CMT mới. Doanh nghiệp đã làm thủ tục cấp MST cho cá nhân này theo số CMT mới.

Theo hướng dẫn của cơ quan thuế, doanh nghiệp phải tra cứu MST đã cấp theo các đường link sau: http://tncnonline.com.vn;http://www.gdt.gov.vn/; vào chức năng Tra cứu thông tin người nộp thuế tiến hành nhập các thông tin cần tra cứu để biết MST của NNT.

Doanh nghiệp cần hướng dẫn NNT tự xác định lại. Nếu đã được cấp MST theo số CMT cũ rồi, nay lại cấp MST khác theo số CMT mới, thì phải làm thủ tục đóng một trong 2 MST và làm thủ tục thay đổi thông tin về số CMT mới cho mã số thuế NNT sử dụng.

Khánh Huyền