Theo đó, trường hợp người nộp thuế nộp nhầm, nộp thừa thuế giá trị gia tăng (GTGT) hàng nhập khẩu cho cơ quan Hải quan trong năm ngân sách, trước khi kết thúc thời hạn chỉnh lý quyết toán ngân sách Nhà nước (NSNN) năm đó mà phát hiện, thì thực hiện điều chỉnh thu NSNN theo mẫu C1-07/NS ban hành kèm theo Quyết định số 759/QĐ-BTC ngày 16/4/2013.

Đồng thời, người nộp thuế nộp bản chính Giấy nộp tiền vào NSNN để cơ quan Hải quan xác nhận, ký tên, đóng dấu lên mặt trước số tiền thuế GTGT điều chỉnh sang khoản thuế khác để Kho bạc Nhà nước hạch toán điều chỉnh thu NSNN.

Nếu người nộp thuế không còn nợ tiền thuế, tiền chậm nộp và đề nghị hoàn trả, thì cơ quan Hải quan ban hành ban hành quyết định hoàn theo mẫu (mẫu 01/LHT ban hành kèm theo Thông tư số 28/2011/TT-BTC) để Kho bạc Nhà nước nơi đã hạch toán thu NSNN đối với khoản thuế GTGT hàng nhập khẩu nộp thừa hoàn trả cho người nộp thuế theo quy định.

Trường hợp khoản thuế GTGT hàng nhập khẩu đã nộp, được hoàn trả ngoài năm ngân sách thì cơ quan hải quan nơi người nhập khẩu mở tờ khai tiếp nhận hồ sơ đề nghị hoàn thuế, ban hành quyết định hoàn tiền thuế, tiền nộp chậm tiền phạt nộp thừa theo mẫu 01/LHT ban hành kèm theo Thông tư số 28/2011/TT-BTC.

Cơ quan Hải quan có trách nhiệm gửi một bản Quyết định hoàn thuế và Lệnh hoàn trả khoản thu NSNN đã ban hành cho cơ quan Thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế để làm cơ sở kiểm tra, đối chiếu và thực hiện quyết toán theo quy định.

Người nộp thuế có trách nhiệm tự kê khai điều chỉnh số thuế GTGT đã được cơ quan Hải quan hoàn nhưng đã kê khai, khấu trừ hoặc được hoàn thuế nội địa trước đó với cơ quan thuế trực tiếp quản lý người nộp thuế.

Thuy Thủy/customs.gov.vn